pub_soft/rdkit
3
0
Fork 0
mirror of https://github.com/rdkit/rdkit.git synced 2026-06-04 21:54:27 +08:00
Code Issues Packages Projects Releases Wiki Activity

- enable building DLLs on Windows (#1861)

Browse Source 
* - enable building DLLs on Windows

* - export.h and test.h are now auto-generated by CMake
This commit is contained in:
Paolo Tosco
2018-05-16 07:42:41 +01:00
committed by Greg Landrum
parent c8ad225657
commit c08ea49bda
507 changed files with 4308 additions and 6863 deletions
Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

104
Code/DataStructs/BitOps.cpp
View File

@@ -163,9 +163,9 @@ bool AllProbeBitsMatch(const T1& probe, const std::string& pkl) {
}
return true;
}
template bool AllProbeBitsMatch(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT bool AllProbeBitsMatch(const SparseBitVect& bv1,
const std::string& pkl);
template bool AllProbeBitsMatch(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT bool AllProbeBitsMatch(const ExplicitBitVect& bv1,
const std::string& pkl);
template <typename T1>
bool AllProbeBitsMatch(const T1& probe, const T1& ref) {
@@ -176,7 +176,7 @@ bool AllProbeBitsMatch(const T1& probe, const T1& ref) {
}
return true;
}
template bool AllProbeBitsMatch(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT bool AllProbeBitsMatch(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
// template bool AllProbeBitsMatch(const ExplicitBitVect& bv1,const
// ExplicitBitVect &bv2);
@@ -724,98 +724,98 @@ void UpdateBitVectFromBinaryText(T1& bv1, const std::string& fps) {
}
}
template double TanimotoSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double TanimotoSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double TverskySimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double TverskySimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2, double a, double b);
template double CosineSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double CosineSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double KulczynskiSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double KulczynskiSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double DiceSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double DiceSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double SokalSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double SokalSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double McConnaugheySimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double McConnaugheySimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double AsymmetricSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double AsymmetricSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double BraunBlanquetSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double BraunBlanquetSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double RusselSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double RusselSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double RogotGoldbergSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double RogotGoldbergSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double OnBitSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double OnBitSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template int NumBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT int NumBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double AllBitSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double AllBitSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template int NumOnBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT int NumOnBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template IntVect OnBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT IntVect OnBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template IntVect OffBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT IntVect OffBitsInCommon(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template DoubleVect OnBitProjSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT DoubleVect OnBitProjSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template DoubleVect OffBitProjSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT DoubleVect OffBitProjSimilarity(const SparseBitVect& bv1,
const SparseBitVect& bv2);
template double TanimotoSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double TanimotoSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double TverskySimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double TverskySimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2, double a,
double b);
template double CosineSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double CosineSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double KulczynskiSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double KulczynskiSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double DiceSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double DiceSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double SokalSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double SokalSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double McConnaugheySimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double McConnaugheySimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double AsymmetricSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double AsymmetricSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double BraunBlanquetSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double BraunBlanquetSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double RusselSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double RusselSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double RogotGoldbergSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double RogotGoldbergSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double OnBitSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double OnBitSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template int NumBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT int NumBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template double AllBitSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT double AllBitSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template IntVect OnBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT IntVect OnBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template IntVect OffBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT IntVect OffBitsInCommon(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template DoubleVect OnBitProjSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT DoubleVect OnBitProjSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template DoubleVect OffBitProjSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT DoubleVect OffBitProjSimilarity(const ExplicitBitVect& bv1,
const ExplicitBitVect& bv2);
template SparseBitVect* FoldFingerprint(const SparseBitVect&, unsigned int);
template ExplicitBitVect* FoldFingerprint(const ExplicitBitVect&, unsigned int);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT SparseBitVect* FoldFingerprint(const SparseBitVect&, unsigned int);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT ExplicitBitVect* FoldFingerprint(const ExplicitBitVect&, unsigned int);
template std::string BitVectToText(const SparseBitVect&);
template std::string BitVectToText(const ExplicitBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToText(const SparseBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToText(const ExplicitBitVect&);
template std::string BitVectToFPSText(const SparseBitVect&);
template std::string BitVectToFPSText(const ExplicitBitVect&);
template void UpdateBitVectFromFPSText(SparseBitVect&, const std::string&);
template void UpdateBitVectFromFPSText(ExplicitBitVect&, const std::string&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToFPSText(const SparseBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToFPSText(const ExplicitBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT void UpdateBitVectFromFPSText(SparseBitVect&, const std::string&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT void UpdateBitVectFromFPSText(ExplicitBitVect&, const std::string&);
template std::string BitVectToBinaryText(const SparseBitVect&);
template std::string BitVectToBinaryText(const ExplicitBitVect&);
template void UpdateBitVectFromBinaryText(SparseBitVect&, const std::string&);
template void UpdateBitVectFromBinaryText(ExplicitBitVect&, const std::string&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToBinaryText(const SparseBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT std::string BitVectToBinaryText(const ExplicitBitVect&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT void UpdateBitVectFromBinaryText(SparseBitVect&, const std::string&);
template RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT void UpdateBitVectFromBinaryText(ExplicitBitVect&, const std::string&);
// from here:
// http://stackoverflow.com/questions/3849337/msvc-equivalent-to-builtin-popcount